INTRODUÇÃO: Arbovírus são considerados um desafio à saúde pública. A RT-PCR é considerada o padrão-ouro para o diagnóstico de arbovírus, e importante na detecção da infecção na fase inicial. No entanto, para a fase tardia, testes sorológicos são os mais indicados. Testes de sensiveis e especificos são indispensáveis para a investigação em cenários de surtos, cocirculação viral e regiões com histórico endêmico para o DENV. Além da importância na detecção do ZIKV no primeiro trimestre gestacional. Desta forma, o estudo avalia o desempenho de métodos de ensaios sorológicos e molecular na detecção de infecção por arbovírus em amostras de soro. MÉTODOS: Foram avaliados três testes diagnósticos – ELISA IgM ZIKV comercial e um protótipo de teste rápido IgM ZIKV da InBios International e RT-qPCR IBMP ZDC ONE (IBMP, Brasil) comercial para detecção de ZIKV, CHIKV e dos quatros sorotipos do DENV. O primeiro painel (metódos sorológicos) utilizou amostras de períodos anterior, durante e posterior a circulação de ZIKV, apresentando grupos confirmados para DENV, ZIKV, CHIKV, por RT-qPCR Trioplex CDC (Padrão-ouro) e sorologia (ELISA IgM e NS1 DENV), e dois grupos de controles saudáveis. Para o segundo painel (IBMP ZDC), foi utilizado amostras confirmados para DENV, ZIKV, CHIKV por RT-qPCR Trioplex (Padrão-outro) e um grupo de controle saudável. Para ambos paineis foi estimado como indicadores de acurácia, a sensibilidade e especificidade. RESULTADO: Analisando os métodos sorológicos, o desempenho do ELISA IgM ZIKV (96 %) foi superior ao do TR IgM ZIKV (73%) quando analisado a sensibilidade em fase convalescente, contrastando com sua sensibilidade inferior para amostras da fase aguda, 8% ELISA e 6% TR. Entretanto, ambos os testes, ELISA e TR, obtiveram uma especificidade geral de 80% e 82% respectivamente, com um destaque ao grupo de amostras de doenças febris agudas do período de circulação do ZIKV que apresentou uma especificidade inferior (32% para ELISA e 56% para o TR) em comparação aos outros grupos. Entre amostras avaliadas pelo RT-qPCR IBMP ZDC, o grupo CHIKV RT-qPCR apresentou uma sensibilidade superior (77%) em comparação aos demais grupos positivos – ZIKV (48%) e DENV geral (66%). O teste apresentou uma especificídade de 100% para todos os grupos. Verificou-se também que amostras em que o IBMP ZDC não detectou, apresentavam media de Ct com valores mais altos no Trioplex CDC. CONCLUSÃO: O ELISA apresentou um melhor desempenho em relação ao TR, principalmente entre amostras convalescentes para detecção do anticorpo IgM. Contudo, ambos os testes não são indicados para cenários de surtos e epidemias, devido a possível detecção de infecção recente na amostra aguda. E, o IBMP ZDC apresentar da possibilidade de diferenciar os sorotipos de DENV e simplificar o seguimento operacional, demonstrou um desempenho inferior para amostras coletadas mais tardiamente.