Dissertação analisa transcriptômica de modelos celulares de hepatite C

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Discente: João Victor de Oliveira Pimenta Lima
Orientação: Artur Trancoso Lopo de Queiroz
Coorientação: Kiyoshi Ferreira Fukutani
Título da dissertação: “ANÁLISE TRANSCRIPTÔMICA DOS MODELOS CELULARES DE HCV”
Programa: Pós-Graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa
Data de defesa: 28/02/2023
Horário: 10h00
Local: Sala do Zoom
ID da reunião: 849 5047 5296
Senha de acesso: 139189

Resumo

O vírus da hepatite C humana (HCV) é um vírus de RNA de fita simples com polaridade positiva, pertencente à família Flaviviridae e ao gênero hepacivirus. Segundo a Organização Mundial de Saúde (OMS) o HCV infecta aproximadamente 71 milhões de pessoas e com o risco de desenvolverem cirrose e câncer de fígado. O ciclo viral do HCV não é totalmente entendido, pela ausência de modelos
experimentais e falta de consenso, dentre os modelos mais utilizados o Pan troglodytes (chimpanzé) é aquele que apresenta maiores custos, o que o torna inviável para a maioria dos estudos. Dentre os modelos experimentais utilizados para a pesquisa in vitro do HCV existe uma falta de padronização das linhagens celulares, o que gera uma dificuldade em se estabelecer protocolos reprodutíveis da
infecção pelo HCV. Logo, estudos comparativos dos modelos celulares são necessários para identificar o melhor modelo que mimetize a infecção humana, já que padrões específicos de cada linhagem interferem na interpretação dos resultados. Assim com o objetivo de comparar a expressão gênica dos modelos celulares com o de indivíduos saudáveis e infectados por hcv, determinar o padrão de expressão nos diferentes modelos experimentais e identificar o modelo que melhor mimetiza a infecção natural por hcv, utilizamos 83 amostras de tecido de fígado, células de linhagem e biópsia de hepatocarcinoma obtidas de 8 estudos de expressão gênica do hcv provenientes do NCBI GEO BANK para realizar análises
de expressão gênica, análise de perturbação molecular, análise funcional dos genes e de enriquecimento e funcional das vias metabólicas. Palavras chave: HCV; Expressão Gênica; Transcriptoma; Linhagem celular.

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